主要在以下几个方面：
1、工作原理上的不同：
冷干机是根据冷冻除湿的工作原理，将来自上游的饱和压缩空气通过与冷媒的热交换冷却到一定的露点温 度，凝结出大量的液态水，经气液分离器分离后自动排出机外，从而达到除水干燥的目的。吸干机则是根据变压吸附的原理，将来自上游的饱和压缩空气在一定的压力下经过与干燥剂的接触，将绝大部分的水份吸附在干燥剂里，干燥空气进入下游工作，从而达到深度干燥的目的。
2、除水效果上的不同：
冷干机因为受到其原理的制约，如果温度太低的话会出现结冰现象，所以其的露点温度通常在2~10℃。吸干机则因为无须通过温度变化，而干燥剂(氧化铝)则又可以进行深度干燥，所以通常其出口的露点温度可以达到-20℃以下，也就是说可以达到深度干燥。
3、能量损耗上的不同：
对于冷干机来说，因为要通过冷媒压缩作功方可达到冷却的目的，所以在电源功率上会偏高。而吸干机因为只要通过电控箱对阀门进行控制而已，所以通常用电功率只有几十瓦左右，也就是说不会有什么电量上的损耗。
4、气量损耗的不同：
因为冷干机是通过变温来达到除水的目的，水份又是通过自动排水器排出机外，所以没有气量的损耗。而吸干机则因为干燥剂在吸水饱和后需要再生，因些需要有12-15%左右的再生气损耗。
5、故障率的不同：
因为冷干机的冷媒系统和空气系统包括电气部分都相对复杂，而吸干机则只有阀门因要频繁动作而具有故障可能，所以在通常情况下吸干机的故障率要低过冷干机。